Drei Monate sind seit dem schrecklichen Unfall vergangen. Max geht es dank der innovativen Behandlung von Dr. Castro wesentlich besser. Sein Tumor ist geschrumpft und könnte in sechs Monaten sogar ganz verschwunden sein. Liebevoll kümmert er sich um sein Töchterchen Luna. Voll Tatendrang stürzt sich Max in eine neue Aufgabe: Er will die Pharmafirma Placentia dazu zwingen, Insulin kostengünstiger zu verkaufen. Zu viele Patienten können sich das teure Heilmittel nicht leisten und landen daher im Krankenhaus. Doch die Aufsichtsratsvorsitzende Brantley will nichts davon hören. Da greift Max zu einer drastischen Aktion.

Als neue Ko-Leiterin der Onkologie versucht Dr. Castro gemeinsam mit Dr. Sharpe Patienten von ihrer neuen Krebsbehandlung zu überzeugen. Die innovative Heilmethode soll zu geringeren Nebenwirkungen als Chemo- und Strahlentherapien führen. Max führt mit allen 5000 Angestellten des New Amsterdam eine Umfrage durch. Dabei treten ihre prekären Arbeitsbedingungen zutage. Dr. Reynolds ist mit Michael Dukes erstem OP-Einsatz hochzufrieden und vertraut ihm vorschnell einen Patienten von Dr. Bloom an.

Max muss einen neuen Assistenzarzt einstellen. Die Bewerber sind hochqualifiziert - dennoch geht Max mit einem besonderen Assistenten ein großes Risiko ein. Der gesamte Krankenhausflügel wird von einem Virus befallen.

Die neue Krebsbehandlung von Dr. Castro scheint doch nicht so gut anzuschlagen, wie erhofft. Als Dr. Sharpe ihre Ko-Abteilungsleiterin damit konfrontiert, werden ihre Bedenken brüsk zurückgewiesen. Dr. Bloom findet Linderung von ihren Schmerzen in den Armen ihres Arztes Dr. Zach Lidon. Max will wieder einmal Gutes tun und bietet einen kostenlosen Gesundheitscheck in einem Haarsalon an. Doch sein gutgemeintes Service geht nach hinten los.

Sharpe hat es mit einem Fall zu tun, der ihr nahe geht. Sie bittet Max um Hilfe. Iggy und Bloom werden einer Situation ausgesetzt, die für sie den sozialen Extremfall darstellt: Ein Mädchen verhält sich gewaltsam gegenüber ihrem Bruder.

Ein Ansturm von Patientinnen nach einem Autounfall hält Dr. Bloom und ihr Team ordentlich auf Trab. Die Frauen sind Teil einer Kirchengruppe und weisen fast alle schwere Vorerkrankungen auf. Das macht Max stutzig. Als er die tiefreligiöse Leiterin der Gruppe darauf anspricht, hat sie eine ungewöhnliche Erklärung parat. Sie sieht in dem Unfall einen Akt Gottes, der ihren Mitschwestern die dringend erforderlichen Behandlungen ermöglicht hat. Dr. Frome kümmert sich indessen um eine verletzte Jugendliche, die ungewollt schwanger geworden ist.

Dr. Frome wagt ein Experiment mit seiner Therapiegruppe für posttraumatische Belastungsstörungen. Er bereitet mit den Patienten eine griechische Tragödie vor, durch die sie ihren Emotionen Ausdruck verleihen sollen. Während einer Operation an einer Patientin stellt sich ein kapitaler Kunstfehler einer früheren OP heraus. Helen und Max finden den OP-Bericht und entdecken, dass er verfälscht wurde. Bei seinen Nachforschungen wird Max dabei von dem früheren Vorstand Dean Fulton bitter enttäuscht.

Shauna, eine Krebspatientin von Dr. Sharpe, wird mit einer fast tödlichen Überdosis Heroin eingeliefert. Die verzweifelte Frau nahm das Opiat, um ihre entsetzlichen Schmerzen zu lindern. Als Shauna ausreißt, setzt Dr. Sharpe ihren Job aufs Spiel, um ihr zu helfen. Dr. Bloom bereitet sich auf die Operation an ihrem lädierten Bein vor. Max steht indessen einer schwangeren Frau bei, die gerade ihr Baby verloren hat. Dabei kommen seine Erinnerungen an die traumatischen Ereignisse vor drei Monaten hoch.

Max macht sich mit seinem Team zur Gefängnis-Insel Rikers Island auf, die seit Jahren den weiblichen Häftlingen dringende medizinische Untersuchungen verwehrt. Dabei versucht Dr. Frome eine Insassin und eine Wärterin, die ehemals Schulfreundinnen waren, zu versöhnen. Max' gut gemeinte Intervention artet jedoch bald in Chaos aus. Im New Amsterdam kämpft Dr. Bloom nach ihrer OP mit unerträglichen Schmerzen, während Dr. Reynolds von Evie eine niederschmetternde Nachricht erhält.

Alarmstufe Rot im Krankenhaus! Nachdem einige Patienten des Gefängnisses Rikers Island einen Wärter verletzt haben und mit seiner Waffe geflüchtet sind, wird der "Code Silver" ausgerufen. Ärzte, Pfleger und Patienten müssen sich schnellstens in Sicherheit bringen. Während die Polizei das Krankenhaus sichert, begeben sich Max und Dr. Sharpe in eine hochgefährliche Situation. Inmitten des Chaos überwindet Dr. Bloom ihre Schmerzen und führt eine Notoperation durch. Dr. Frome und sein Mann Martin finden endlich die Zeit für ein dringend notwendiges Gespräch.

Max möchte alle Bildschirme aus dem Krankenhaus verbannen - jeden Fernseher und jedes Handy. Währenddessen finden Max und Luna an einem Ort Freunde, an dem sie es am wenigsten erwartet hätten.

Eine christliche Betgruppe hat ihr Lager im Krankenhaus aufgeschlagen und sorgt scheinbar für ein Wunder: Ein Patient, der jahrelang im Koma gelegen ist, schlägt plötzlich die Augen auf. Dr. Kapoor bleibt jedoch skeptisch und führt dies auf rein biologische Reflexe zurück. Ein 13-jähriger Junge mit Symptomen eines Herzinfarkts konfrontiert Dr. Reynolds mit einer völlig neuen Krankheit. Dr. Sharpe legt sich indessen mit Dr. Castro an, deren neue Krebsstudie nur einer sehr selektiven Patientenauswahl zugute kommt. In der Notaufnahme sorgt ein Computerupdate für Chaos.

Auf das New Amsterdam kommen große Veränderungen zu, nachdem die Ärzte eine schockierende Erkenntnis gemacht haben. Reynolds muss eine wichtige Entscheidung in seiner Karriere treffen.

Max versucht, das Budget des New Amsterdams neu zu ordnen. Unterdessen wird Kapoor ein Gerät präsentiert, das die Zukunft der Medizin darstellen soll, und Bloom bekommt unerwarteten Besuch.

Max wächst der Stress über den Kopf, sodass er seine Wut an Unschuldigen auslässt. Im New Amsterdam wird ein Junge eingeliefert, dessen Körper sich gegen ein neu transplantiertes Herz wehrt.

Das Krankenhaus wird mit einer Klage wegen eines Behandlungsfehlers mit Todesfolge konfrontiert. Dr. Bloom, Dr. Reynolds und Max werden zu Evie in die Rechtsabteilung zitiert, um die genauen Abläufe zu schildern. Dr. Frome behandelt ein Mädchen, das sich weigert, in die Schule zu gehen. Bald stellt sich heraus, dass die Schülerin von einem Test-Drill eines Amoklaufs an ihrer Schule völlig traumatisiert wurde. Dr. Sharpe hat nun eindeutige Beweise gegen Dr. Castro in der Hand.

Max’ Crowdfunding-Video für ein krankes Mädchen ist ein voller Erfolg. Die Spendengelder fließen reichlich und Max ist plötzlich ein Internet-Star. Brantley ist begeistert und will solche Kampagnen auch für andere Patienten starten. Dr. Kapoor macht mit einem querschnittsgelähmten ehemaligen Piloten den Versuch, über eine Elektroden-Armprothese seine Finger zu bewegen. An seinem letzten Tag im Krankenhaus hilft Dr. Reynolds einem jungen Mann in Not.

Der neue Trauma-Chirurg Dr. Cassian Shin macht sich durch sein arrogantes Auftreten nicht gerade viele Freunde. Doch als mehrere Patienten nach dem Einsturz eines Gerüsts in die Notaufnahme eingeliefert werden, zeigt er seine Kompetenz. Max versucht, einen Jungen mit einer degenerativen Muskelschwäche in eine lebensrettende Studie zu bringen, die sehr strenge Aufnahmekriterien hat. Ein Mann, der wegen Waffenbesitzes vor Gericht steht, stürzt Dr. Frome in ein moralisches Dilemma. Die sexuellen Avancen der Ehefrau eines Patienten machen Dr. Kapoor schwer zu schaffen.